Desconocemos la fecha de su nacimiento, aunque suele situarse a finales del siglo VI o en torno al año 600. No sabemos nada de sus primeros años, tan solo que formaba parte de la Iglesia de Toledo, ciudad en la que recibió su primera formación escolar. Más tarde marchó a Zaragoza, donde ingresó en el monasterio que se levantaba junto al sepulcro de los XVIII Mártires en la iglesia de Santa Engracia. Es difícil precisar el momento de esta marcha al igual que sus causas. La hipótesis más razonable es que Eugenio se trasladó a Zaragoza con la intención de completar su formación literaria atraído por la figura de Braulio que ya por entonces gozaba de una reputada fama de hombre sabio y erudito. Se trataría así de un viaje con una finalidad formativa. Probablemente el abad de este monasterio era Juan, hermano de Braulio, lo que situaría la llegada de Eugenio a Zaragoza antes del 619. Aquí perfeccionó sus estudios, primero en la escuela monástica, más tarde en la episcopal. Esta etapa zaragozana de la vida de Eugenio fue la que consolidó su formación.
Resumen biográfico extraído de Wikipedia en español: <blockquote>"Eugenio de Toledo (? - 657) fue un obispo, escritor y poeta español de la época visigoda. Es uno de los Padres de la Iglesia hispánica. Fue discípulo de Braulio de Zaragoza, estudiando con él en la Iglesia de Santa Engracia de esa ciudad. Supo fundir las enseñanzas de su maestro y de Isidoro de Sevilla. Destacó, además de por su actividad poética, como músico y teólogo. Fue nombrado obispo de Toledo y es considerado como el iniciador del arzobispado de esta ciudad tras ser designado en el 649 por Chindasvinto."</blockquote>
Abstract from English Wikipedia: <blockquote>"Saint Eugenius II (died 13 November 657), sometimes called Eugenius the Younger as the successor of Eugenius I, was Archbishop of Toledo from 647 until his death. He is called Eugenius secundus (Eugene the second) in the biography of Archbishop Julian of Toledo by a certain Felix, but in later histories he is sometimes numbered Eugenius III when a legendary martyr and first bishop of Toledo is included."</blockquote>