La Universidad de Franeker (activa entre 15851811) era una universidad situada en Franeker, en la provincia de Frisia, parte de la actual Holanda. Era la segunda universidad más antigua de Holanda, fundada poco después de la Universidad de Leiden. También conocida como Academiæ Franekerensis o «Universidad de Friesland». La universidad estaba constituida por los departamento de Teología, Leyes, Medicina, Filosofía, Matemáticas y Física. En sus inicios la universidad tenía una excelente reputación y prestigio, atrayendo estudiantes de lejanas tierras, pero a partir de 1700 empezó su declive. La universidad fue disuelta por Napoleón en 1811.