Fundado en 1985 por el catedrático López Piñero con el nombre Instituto de Estudios Históricos y Documentales sobre la Ciencia. Tiene su antecedente en el Instituto de Historia de la Medicina creado por el mismo fundador en los años 70. Contó desde sus inicios con una Biblioteca y un Museo Histórico-médicos, y con el Centro de Documentación e Información en Biomedicina dirigido por María-Luz Terrada Ferrandis. Los objetivos del centro eran el estudio de la actividad científica española e iberoamericana, el estudio de los sistemas médicos, la elaboración de repertorios bibliográficos y documentales, la obtención de indicadores de la actividad científica y sanitaria, la creación de repertorios bibliográficos y bases de datos (entre ellas, el Índice Médico Español y la base de datos IME), el desarrollo de sistemas de información médica, el estudio de la terminología científica y el estudio de las necesidades de información científica y médica. El Instituto fue reestructurado en 2008, concentrando su actividad investigadora en la historia de la medicina y de la ciencia, e integrando la Biblioteca histórico-médica Vicente Peset Llorca y el nuevo Museo de Historia de la Medicina y de la Ciencia en el propio Instituto. El Instituto está integrado en la Universidad de Valencia.